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3 Perguntas: computação para estudar os melhores químicos unicelulares

Nova professora no MIT une biologia e ciência da computação para linguagem genômica, buscando entender proteínas no contexto genômico e aplicações em materiais e terapias

New faculty member Yunha Hwang once wanted to be an astronaut and instead found a close equivalent to studying life in space: the novel biology of organisms that survive and thrive in extreme environments, many of which cannot be cultivated in the lab. Hwang is using the power of computation to explore microbial diversity and map the evolutionary relationships between each instance of life.
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  • Nova professora no MIT, Yunha Hwang, assume posição dupla em Biologia e EECS/Computação e trabalha com linguagem genômica para analisar DNA e entender funções proteicas “in silico”.
  • O objetivo é incorporar contexto genômico além da simples similaridade de sequência, aplicando isso a materiais, terapias, polímeros e modelagem de fluxos de carbono e nitrogênio no ambiente.
  • O conceito central é um modelo de linguagem genômica — parecido com grandes modelos de linguagem, mas treinado com a linguagem do DNA para compreender a biologia a partir de dados genômicos.
  • Metagenômica é essencial porque a maioria dos micróbios não pode ser cultivada em laboratório; menos de 1% dos genes conhecidos tem funções validadas.
  • A pesquisa destaca o potencial dos micróbios para química sustentável, produção de novos materiais e terapias, além de contribuir para entender ciclos biogeoquímicos e o combate a patógenos.

Nova professora no MIT atua em interseção entre biologia e computação, buscando traduzir dados genômicos em linguagem utilizável para entender proteínas. A atuação ocorre em posição dupla, Biologia e EECS, com foco em modelagem genômica in silico.

Yunha Hwang integra o corpo docente como Samuel A. Goldblith Career Development Professor em Biologia, além de professora assistente em EECS e MIT Schwarzman College of Computing. A proposta é ampliar o uso de contextos genômicos além da similaridade de sequências.

A pesquisadora pretende desenvolver um modelo de linguagem genômica, similar a modelos de linguagem, mas treinado com DNA. O objetivo é desvendar funções proteicas com dados de composição genética, indo além a simples correlação de sequências.

Contexto científico

O objetivo é incorporar o contexto genômico para entender como genes e regiões adjacentes influenciam a função de proteínas. A ideia é mapear unidades gênicas que trabalham em conjunto, conectando arquitetura genômica à função biológica.

Aplicações potenciais

Pesquisas podem orientar a produção de materiais, terapias e polímeros, promovendo sustentabilidade. Além disso, entender fluxos de carbono e nitrogênio a partir de microorgânicos ajuda a modelar biogeoquímica ambiental e resposta a mudanças climáticas.

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